{"id":2774,"date":"2019-11-23T15:06:52","date_gmt":"2019-11-23T06:06:52","guid":{"rendered":"https:\/\/analysis-navi.com\/?p=2774"},"modified":"2025-06-08T21:36:23","modified_gmt":"2025-06-08T12:36:23","slug":"%e7%b3%bb%e7%b5%b1%e8%a7%a3%e6%9e%90%e3%81%a8%e3%81%af%e3%80%9c%e6%95%b0%e7%90%86%e3%81%a7%e8%aa%ad%e3%81%bf%e8%a7%a3%e3%81%8f%e9%80%b2%e5%8c%96%e3%81%ae%e6%ad%b4%e5%8f%b2%e3%80%9c","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/analysis-navi.com\/?p=2774","title":{"rendered":"\u300c\u7cfb\u7d71\u89e3\u6790\u300d\u306e\u610f\u5473\u3068\u69d8\u3005\u306a\u624b\u6cd5"},"content":{"rendered":"\n

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\"\"<\/figure>\n\n\n\n\n\n\n\n

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DNA\u30c7\u30fc\u30bf\u306e\u53ce\u96c6<\/h2>\n\n\n\n

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\u308f\u3056\u308f\u3056\u81ea\u5206\u3067\u751f\u7269\u304b\u3089\u62bd\u51fa\u3057\u3066\u304f\u308b\u306a\u3069\u3068\u8a00\u3046\u3053\u3068\u306f\u7121\u304f\u3001\u65e2\u306bWeb\u4e0a\u3067\u7121\u511f\u516c\u958b\u3055\u308c\u3066\u3044\u308b\u30c7\u30fc\u30bf\u3092\u5f15\u3063\u5f35\u3063\u3066\u304d\u307e\u3059\u3002<\/span><\/strong><\/p>\n\n\n\n

\u6709\u540d\u306a\u30b5\u30a4\u30c8\u3067\u306f\u300cDDBJ<\/a>\u300d\u300cGenBank<\/a>\u300d\u306a\u3069\u304c\u3042\u308a\u307e\u3059\u3002<\/p>\n\n\n\n

\u307e\u305f\u3001\u4f55\u5341\u5104\u306b\u3082\u306e\u307c\u308b\u914d\u5217\u5168\u3066\u3092\u5206\u6790\u306b\u4f7f\u3046\u3001\u3068\u3044\u3046\u3053\u3068\u3082\u901a\u5e38\u3042\u308a\u307e\u305b\u3093\u3002
DNA\u306b\u3082\u69d8\u3005\u306a\u300c\u9818\u57df\u300d\u304c\u3042\u308a\u3001\u89e3\u6790\u3057\u305f\u3044\u751f\u7269\u306e\u300c\u3042\u308b\u9818\u57df\u300d\u306e\u30c7\u30fc\u30bf\u306b\u7d5e\u3063\u3066\u5206\u6790\u3057\u307e\u3059\u3002<\/span><\/strong><\/p>\n\n\n\n

\u3053\u306e\u300c\u9818\u57df\u300d\u3082\u3001\u307e\u3063\u305f\u304f\u9032\u5316\u3084\u907a\u4f1d\u306b\u95a2\u4fc2\u306a\u3044\u90e8\u5206\u3092\u4f7f\u3063\u3066\u3082\u4ed5\u65b9\u306a\u3044\u306e\u3067\u3001\u304d\u3061\u3093\u3068\u9078\u5b9a\u3059\u308b\u5fc5\u8981\u304c\u3042\u308a\u307e\u3059\u3002
\u3068\u3044\u3063\u3066\u3082\u3001\u5bfe\u8c61\u306e\u751f\u7269\u306a\u3069\u306b\u3088\u3063\u3066\u3082\u6700\u9069\u306a\u9818\u57df\u306f\u5909\u308f\u308a\u307e\u3059\u306e\u3067\u3001\u4e00\u6982\u306b\u300c\u3053\u306e\u9818\u57df\u3092\u4f7f\u3044\u307e\u3057\u3087\u3046\uff01\u300d<\/strong>\u3068\u306f\u8a00\u3048\u307e\u305b\u3093\u3002
\u305f\u3060\u300116S rRNA\u308423S rRNA\u9818\u57df\u3092\u7528\u3044\u308b\u3068\u6b63\u78ba\u6027\u306e\u9ad8\u3044\u7cfb\u7d71\u89e3\u6790\u304c\u3067\u304d\u308b<\/span><\/strong>\u3068\u8a00\u308f\u308c\u3066\u3044\u307e\u3059\u3002<\/p>\n\n\n\n

\u4f7f\u3046\u9818\u57df\u3092\u6c7a\u3081\u305f\u3089\u5148\u8ff0\u3057\u305f\u30b5\u30a4\u30c8\u3067\u30c7\u30fc\u30bf\u3092\u53d6\u5f97\u3057\u3066\u304d\u307e\u3059\u3002<\/p>\n\n\n\n

\u30c7\u30fc\u30bf\u306e\u5f62\u5f0f\u3082\u300cFASTA\u300d\u300cPHYLIP\u300d\u300cNEXUS\u300d<\/strong>\u306a\u3069\u3001\u5e7e\u3064\u304b\u7a2e\u985e\u304c\u3042\u308a\u307e\u3059\u3002
\u6700\u3082\u5e83\u304f\u4f7f\u308f\u308c\u3066\u3044\u308b\u306e\u306fFASTA\u5f62\u5f0f\u304b\u3068\u601d\u308f\u308c\u307e\u3059\u304c\u3001\u30c4\u30fc\u30eb\u306b\u3088\u3063\u3066\u306fFASTA\u5f62\u5f0f\u3092\u53d7\u3051\u4ed8\u3051\u306a\u3044\u3082\u306e\u3082\u3042\u308a\u307e\u3059\u3002
\u3069\u3093\u306a\u30c4\u30fc\u30eb\u3067\u89e3\u6790\u3092\u884c\u3046\u304b\u306b\u3088\u3063\u3066\u5909\u308f\u308a\u307e\u3059\u306e\u3067\u3001\u304d\u3061\u3093\u3068\u4f7f\u3046\u4e88\u5b9a\u306e\u30c4\u30fc\u30eb\u306e\u53d7\u3051\u5165\u308c\u53ef\u80fd\u306a\u5f62\u5f0f\u306f\u8abf\u3079\u3066\u304a\u304d\u307e\u3057\u3087\u3046\u3002<\/span><\/strong><\/p>\n\n\n\n

\u7cfb\u7d71\u6a39\u4f5c\u6210\u306e\u305f\u3081\u306e\u524d\u6e96\u5099(\u30a2\u30e9\u30a4\u30e1\u30f3\u30c8)<\/h2>\n\n\n\n

\u3055\u3066\u3001\u7cfb\u7d71\u89e3\u6790\u3057\u305f\u3044\u751f\u7269\u306e\u30c7\u30fc\u30bf\u304c\u96c6\u307e\u3063\u305f\u3089\u3001\u3044\u3088\u3044\u3088\u89e3\u6790\u30fb\u30fb\u30fb\u3067\u3059\u304c\u3001\u524d\u6e96\u5099\u304c\u3042\u308a\u307e\u3059\u3002<\/p>\n\n\n\n

1\u3064\u5206\u6790\u3059\u308b\u306b\u3042\u305f\u3063\u3066\u554f\u984c\u3068\u306a\u308b\u306a\u306e\u304c\u3001\u300c\u751f\u7269\u306b\u3088\u3063\u3066DNA\u306e\u9577\u3055\u306f\u307e\u3061\u307e\u3061\u300d<\/span><\/strong>\u3068\u3044\u3046\u3053\u3068\u3067\u3059\u3002\uff08\u8fd1\u3044\u751f\u7269\u540c\u58eb\u306a\u3089\u3070\u9577\u3055\u304c\u540c\u3058\u3068\u3044\u3046\u4e8b\u3082\u3042\u308a\u307e\u3059\u3002\uff09<\/p>\n\n\n\n

\u306a\u305c\u751f\u7269\u306b\u3088\u3063\u3066\u914d\u5217\u306e\u9577\u3055\u304c\u5909\u308f\u3063\u3066\u3057\u307e\u3046\u304b\u3068\u8a00\u3048\u3070\u3001\u9032\u5316\u306e\u904e\u7a0b\u3067DNA\u304c\u5909\u7570\u3059\u308b\u3060\u3051\u3067\u306a\u304f\u3001\u300c\u633f\u5165\u300d\u3084\u300c\u6b20\u5931\u300d\u3068\u3044\u3046\u5909\u5316\u3082\u8d77\u3053\u308b\u304b\u3089<\/span><\/strong>\u3067\u3059\u3002<\/p>\n\n\n\n

\u7cfb\u7d71\u89e3\u6790\u306b\u304a\u3044\u3066\u306f\u3001\u591a\u304f\u306e\u5834\u5408\u3001\u9577\u3055\u304c\u3070\u3089\u3070\u3089\u3060\u3068\u5206\u6790\u304c\u96e3\u3057\u3044\u305f\u3081\u914d\u5217\u306e\u9577\u3055\u3092\u63c3\u3048\u308b\u4f5c\u696d\u304c\u5fc5\u8981\u3067\u3059\u3002
\u3053\u306e\u4f5c\u696d\u306e\u3053\u3068\u3092\u300c\u30a2\u30e9\u30a4\u30e1\u30f3\u30c8\u300d<\/strong>\u3068\u547c\u3073\u307e\u3059\u3002<\/p>\n\n\n\n

\u4f8b\u3048\u3070\u3001\u300cACTG\u300d\u3068\u3044\u3046\u914d\u5217\u3068\u300cATG\u300d\u3068\u3044\u3046\u914d\u5217\u304c\u3042\u3063\u305f\u3089\u3001\u5f8c\u8005\u3092\u300cA-TG\u300d\u3068\u3059\u308c\u3070\u9577\u3055\u304c\u5408\u3046\u4e0a\u306b\u30012\u3064\u306e\u914d\u5217\u306e\u4e26\u3073\u304c\u8fd1\u304f\u306a\u308a\u307e\u3059\u3002
\u3053\u306e\u3088\u3046\u306b\u3001\u95c7\u96f2\u306b\u9577\u3055\u3092\u63c3\u3048\u308c\u3070\u826f\u3044\u306e\u3067\u306f\u306a\u304f\u3001\u306a\u308b\u3079\u304f\u30c7\u30fc\u30bf\u5168\u4f53\u304c\u30d0\u30e9\u30d0\u30e9\u306b\u306a\u3089\u306a\u3044\u3088\u3046\u306b\u7a7a\u767d(\u30ae\u30e3\u30c3\u30d7\u3068\u547c\u3070\u308c\u307e\u3059)\u3092\u5165\u308c\u3001\u9577\u3055\u3092\u63c3\u3048\u307e\u3059\u3002<\/span><\/strong>
(\u3053\u306e\u3042\u305f\u308a\u306e\u8a71\u306f\u9032\u5316\u8ddd\u96e2\u306e\u8a18\u4e8b<\/a>\u306b\u3001\u3082\u3046\u5c11\u3057\u8a73\u3057\u304f\u8a18\u3057\u3066\u3044\u307e\u3059\u3002)<\/p>\n\n\n\n

\u3053\u306e\u4f5c\u696d\u3092\u624b\u4f5c\u696d\u3067\u884c\u3046\u306e\u306f\u307b\u307c\u7121\u7406\u306a\u306e\u3067\u3001\u65e2\u5b58\u306e\u30a2\u30e9\u30a4\u30e1\u30f3\u30c8\u7528\u30a2\u30eb\u30b4\u30ea\u30ba\u30e0\u3092\u5229\u7528\u3057\u3066\u81ea\u52d5\u3067\u884c\u3044\u307e\u3059\u3002
\u3053\u308c\u306b\u3082\u300cClustalW\u300d\u300cMAFFT\u300d\u300cT-Coffee\u300d<\/strong>\u306a\u3069\u69d8\u3005\u306a\u7a2e\u985e\u304c\u3042\u308a\u3001\u3069\u308c\u3082\u4e00\u9577\u4e00\u77ed\u304c\u3042\u308a\u307e\u3059\u3002
\u3057\u304b\u3082\u3001\u305d\u308c\u305e\u308c\u306e\u30e1\u30bd\u30c3\u30c9\u5185\u306b\u3082\u69d8\u3005\u306a\u30cf\u30a4\u30d1\u30fc\u30d1\u30e9\u30e1\u30fc\u30bf\u304c\u3042\u308a\u307e\u3059\u3002<\/p>\n\n\n\n

\u4f7f\u3046\u30e1\u30bd\u30c3\u30c9\u3084\u30d1\u30e9\u30e1\u30fc\u30bf\u306b\u3088\u308a\u5f97\u3089\u308c\u308b\u7d50\u679c\u306f\u7570\u306a\u308a\u307e\u3059\u304c\u3001\u9032\u5316\u306e\u904e\u7a0b\u304c\u5206\u304b\u3089\u306a\u3044\u4ee5\u4e0a\u3001\u3069\u306e\u30a2\u30e9\u30a4\u30e1\u30f3\u30c8\u7d50\u679c\u304c\u6b63\u89e3\u306a\u306e\u304b\u3082\u5206\u304b\u308a\u307e\u305b\u3093\u3002
\u7d50\u679c\u3092\u4eba\u9593\u304c\u898b\u3066\u9055\u548c\u611f\u304c\u7121\u3044\u7d50\u679c\u306a\u3089\u4e00\u5148\u305a\u306fOK<\/span><\/strong>\u3068\u8003\u3048\u307e\u3059\u3002
\uff08\u30c7\u30fc\u30bf\u91cf\u304c\u5c11\u306a\u3051\u308c\u3070\u3001\u4eba\u9593\u304c\u7d50\u679c\u3092\u898b\u3066\u5fae\u8abf\u6574\u3059\u308b\u5834\u5408\u3082\u3042\u308a\u307e\u3059\u3002\uff09<\/p>\n\n\n\n

\u7cfb\u7d71\u6a39\u306e\u4f5c\u6210<\/h2>\n\n\n\n

\u3055\u3066\u3001\u3053\u308c\u3067\u3044\u3088\u3044\u3088\u7cfb\u7d71\u6a39\u304c\u4f5c\u6210\u3067\u304d\u307e\u3059\u3002
DNA\u306e\u914d\u5217\u3092\u898b\u3066\u3001\u3069\u306e\u751f\u7269\u540c\u58eb\u304c\u3069\u308c\u307b\u3069\u8fd1\u3044\u304b\u3092\u8abf\u3079\u3001\u305d\u306e\u60c5\u5831\u3092\u57fa\u306b\u5168\u30c7\u30fc\u30bf\u306e\u95a2\u4fc2\u6027\u3092\u9023\u7d50\u3057\u3066\u4e00\u3064\u306e\u300c\u7cfb\u7d71\u6a39\u300d\u3092\u4f5c\u3063\u3066\u3044\u304d\u307e\u3059\u3002
\u6a5f\u68b0\u5b66\u7fd2\u306e\u7528\u8a9e\u3092\u4f7f\u3048\u3070\u3001\u307e\u3055\u306b\u300c\u968e\u5c64\u578b\u30af\u30e9\u30b9\u30bf\u30ea\u30f3\u30b0<\/a>\u300d\u305d\u306e\u3082\u306e<\/span><\/strong>\u3067\u3059\u3002<\/p>\n\n\n\n

\nhttps:\/\/analysis-navi.com\/?p=1805\n<\/div><\/figure>\n\n\n\n

\u3057\u304b\u3057\u3001\u4eca\u56de\u306f\u5bfe\u8c61\u304c\u751f\u7269\u306eDNA\u30c7\u30fc\u30bf\u3068\u3044\u3046\u3053\u3068\u3067\u3001\u5f93\u6765\u6a5f\u68b0\u5b66\u7fd2\u3067\u826f\u304f\u4f7f\u308f\u308c\u308b\u30af\u30e9\u30b9\u30bf\u30ea\u30f3\u30b0\u624b\u6cd5\u3092\u305d\u306e\u307e\u307e\u9069\u7528\u3059\u308b\u3053\u3068\u306f\u7a00\u3067\u3059\u3002
\u7cfb\u7d71\u89e3\u6790\u306e\u305f\u3081\u306b\u751f\u307e\u308c\u305f\u968e\u5c64\u578b\u30af\u30e9\u30b9\u30bf\u30ea\u30f3\u30b0\u624b\u6cd5<\/span><\/strong>\u304c\u5e7e\u3064\u304b\u3042\u308a\u3001\u5927\u5225\u3059\u308b\u3068\u4ee5\u4e0b\u306b\u5206\u3051\u3089\u308c\u307e\u3059\u3002<\/p>\n\n\n\n

\u8ddd\u96e2\u884c\u5217\u6cd5<\/h3>\n\n\n\n


\u69d8\u3005\u306a\u5834\u9762\u3067\u3067\u826f\u304f\u4f7f\u308f\u308c\u308b\u30af\u30e9\u30b9\u30bf\u30ea\u30f3\u30b0\u306b\u8fd1\u3044\u65b9\u6cd5\u3067\u3059\u3002
\u30c7\u30fc\u30bf\u304b\u3089\u5168\u3066\u306e\u30da\u30a2\u9593\u306e\u8ddd\u96e2\u3092\u8a08\u7b97\u3057\u3001\u305d\u306e\u8ddd\u96e2\u304c\u5c0f\u3055\u3044\u65b9\u304b\u3089\u30c7\u30fc\u30bf\u3092\u304f\u3063\u3064\u3051\u3066\u3044\u304d\u307e\u3059\u3002
\u751f\u7269\u304c100\u7a2e\u985e\u3042\u3063\u305f\u3089\u3001\\(_{100}C_{2}\\)\u30674950\u500b\u306e\u8ddd\u96e2\u3092\u8a08\u7b97\u3059\u308b\u5fc5\u8981\u304c\u3042\u308a\u307e\u3059\u3002<\/p>\n\n\n\n

\u307e\u305f\u3001\u3053\u306e\u8ddd\u96e2\u306e\u8a08\u7b97\u306b\u306fDNA\u914d\u5217\u5c02\u7528\u306e\u8a08\u7b97\u304c\u5fc5\u8981<\/span><\/strong>\u3067\u3059\u3002
\u78ba\u304b\u306b\u3001\u300cACGTTCGTTC\u300d\u3068\u300cCATTACGTAC\u300d\u306e\u8ddd\u96e2\u306f\uff1f\u3068\u8a00\u308f\u308c\u3066\u3082\u96e3\u3057\u3044\u3067\u3059\u306d\u3002<\/p>\n\n\n\n

\u3053\u306e\u3001DNA\u914d\u5217\u5c02\u7528\u306e\u8ddd\u96e2\u3092\u300c\u9032\u5316\u8ddd\u96e2\u300d\u3084\u300c\u907a\u4f1d\u7684\u5dee\u7570\u300d\u3068\u547c\u3073\u307e\u3059\u3002<\/span><\/strong>
\u9032\u5316\u8ddd\u96e2\u306b\u3082\u591a\u6570\u3042\u308b\u306e\u3067\u3001\u3053\u308c\u3082\u4f55\u304b\u3072\u3068\u3064\u9078\u3070\u306a\u3051\u308c\u3070\u3044\u3051\u307e\u305b\u3093\u3002
\u8a73\u3057\u304f\u306f\u9032\u5316\u8ddd\u96e2\u306e\u8a18\u4e8b<\/a>\u3092\u3054\u89a7\u304f\u3060\u3055\u3044\u3002<\/p>\n\n\n\n

\nhttps:\/\/analysis-navi.com\/?p=841\n<\/div><\/figure>\n\n\n\n

\u307e\u305f\u3001\u30af\u30e9\u30b9\u30bf\u30ea\u30f3\u30b0\u624b\u6cd5\u3082\u5e7e\u3064\u304b\u3042\u308a\u307e\u3059\u3002
\u4e00\u822c\u7684\u306a\u968e\u5c64\u578b\u30af\u30e9\u30b9\u30bf\u30ea\u30f3\u30b0\u3067\u3082\u7528\u3044\u3089\u308c\u308bUPGMA\u6cd5\u306a\u3069\u3092\u9069\u7528\u3059\u308b\u5834\u5408\u3082\u3042\u308a\u307e\u3059\u304c\u3001\u7cfb\u7d71\u89e3\u6790\u306b\u304a\u3044\u3066\u306f\u300c\u8fd1\u96a3\u7d50\u5408\u6cd5(NJ\u6cd5)\u300d\u3092\u4f7f\u3046\u306e\u304c\u30e1\u30b8\u30e3\u30fc<\/span><\/strong>\u3067\u3059(2019\u5e74\u73fe\u5728)\u3002<\/p>\n\n\n\n

\u901a\u5e38\u306e\u30af\u30e9\u30b9\u30bf\u30ea\u30f3\u30b0\u306f\u3069\u306e\u8981\u7d20\u304c\u8fd1\u3044\u304b\u9060\u3044\u304b\u306e\u307f\u5206\u304b\u308c\u3070OK\u306a\u4e8b\u304c\u591a\u3044\u306e\u3067\u3059\u304c\u3001\u7cfb\u7d71\u89e3\u6790\u3067\u306f\u305d\u308c\u3060\u3051\u3067\u306a\u304f\u300c\u679d\u306e\u9577\u3055(=\u5206\u5c90\u3057\u3066\u304b\u3089\u3069\u308c\u307b\u3069\u306e\u5e74\u6708\u304c\u7d4c\u3063\u305f\u304b)\u300d\u304c\u91cd\u8981<\/span><\/strong>\u306b\u306a\u3063\u3066\u304d\u307e\u3059\u3002
NJ\u6cd5\u306f\u3001\u30c7\u30fc\u30bf\u3092\u6975\u529b\u3001\u679d\u306e\u9577\u3055\u306b\u53cd\u6620\u3055\u305b\u305f\u30af\u30e9\u30b9\u30bf\u30ea\u30f3\u30b0\u624b\u6cd5\u3068\u306a\u3063\u3066\u3044\u307e\u3059\u3002<\/p>\n\n\n\n

\u8ddd\u96e2\u884c\u5217\u6cd5\u3092\u7528\u3044\u3066\u7cfb\u7d71\u89e3\u6790\u3067\u304d\u308b\u30c4\u30fc\u30eb\u306b\u306f\u3001\u300cMEGA\u300d\u300cPhylip\u300d<\/strong>\u306a\u3069\u304c\u3042\u308a\u307e\u3059\u3002<\/p>\n\n\n\n

\u6700\u5927\u7bc0\u7d04\u6cd5<\/h3>\n\n\n\n

\u6700\u5927\u7bc0\u7d04\u6cd5\u306f\u3001\u8ddd\u96e2\u884c\u5217\u6cd5\u306e\u3088\u3046\u306b\u30da\u30a2\u9593\u306e\u8ddd\u96e2\u3092\u9010\u4e00\u8a08\u7b97\u3059\u308b\u306e\u3067\u306f\u306a\u304f\u3001\u914d\u5217\u5168\u4f53\u306e\u30c7\u30fc\u30bf\u3092\u4e00\u6c17\u306b\u898b\u307e\u3059\u3002
\u7cfb\u7d71\u6a39\u3092\u5c11\u3057\u305a\u3064\u69cb\u7bc9\u3057\u3066\u3086\u304f\u306e\u3067\u306f\u306a\u304f\u3001\u307e\u305a\u8003\u3048\u3089\u308c\u308b\u6a39\u5f62\u3092\u5168\u30d1\u30bf\u30fc\u30f3\u4f5c\u3063\u3066\u3057\u307e\u3044\u307e\u3059\u3002<\/span><\/strong>
\u305d\u306e\u5f8c\u3067\u3001\u305d\u308c\u305e\u308c\u306e\u6a39\u5f62\u304c\u3069\u308c\u307b\u3069\u4fe1\u6191\u6027\u306e\u3042\u308b\u3082\u306e\u304b\uff1f\u30fb\u30fb\u30fb\u3068\u3044\u3046\u8a08\u7b97\u3092\u884c\u3044\u3001\u6700\u3082\u4fe1\u6191\u6027\u306e\u9ad8\u3044\u6a39\u5f62\u3092\u63a2\u3057\u307e\u3059\u3002<\/p>\n\n\n\n

\u751f\u7269\u7a2e\u6570\u304c\u591a\u304f\u306a\u308b\u3068\u3001\u3044\u304f\u3089\u30b3\u30f3\u30d4\u30e5\u30fc\u30bf\u306b\u8a08\u7b97\u3055\u305b\u308b\u3068\u8a00\u3063\u3066\u3082\u7dcf\u5f53\u308a\u3067\u6a39\u5f62\u3092\u898b\u3066\u3044\u304f\u306e\u306f\u5927\u5909\u3067\u3059\u3002
\u306a\u306e\u3067\u3001\u5168\u90e8\u306e\u6a39\u5f62\u3092\u8abf\u3079\u308b\u306e\u3067\u306f\u306a\u304f\u3001\u6b63\u89e3\u306b\u30a2\u30bf\u30ea\u3092\u4ed8\u3051\u3066\u305d\u306e\u5468\u8fba\u306e\u6a39\u5f62\u3092\u96c6\u4e2d\u7684\u306b\u898b\u3066\u3044\u304f\u300c\u679d\u5208\u308a\u300d\u306e\u624b\u6cd5\u3092\u53d6\u308b<\/span><\/strong>\u3053\u3068\u3082\u3042\u308a\u307e\u3059\u3002
\uff08\u8ddd\u96e2\u884c\u5217\u6cd5\u3067\u7cfb\u7d71\u6a39\u3092\u66f8\u304d\u3001\u305d\u306e\u7cfb\u7d71\u6a39\u3092\u5c11\u3057\u3044\u3058\u3063\u3066\u4f5c\u308c\u308b\u6a39\u5f62\u3060\u3051\u3092\u8abf\u67fb\u5bfe\u8c61\u306b\u3059\u308b\u3001\u306a\u3069\uff09<\/p>\n\n\n\n

\u88dc\u8db3<\/span>\n

\\(n\\)\u751f\u7269\u7a2e\u306b\u304a\u3051\u308b\u8003\u3048\u3089\u308c\u308b\u6a39\u5f62\u306f
\\[\\prod_{i=1}^{n-2} (2i+1)\\]
\u3067\u8a08\u7b97\u3067\u304d\u307e\u3059\u30023\u751f\u7269\u306a\u3089\u8003\u3048\u3089\u308c\u308b\u6a39\u5f62\u306f3\u901a\u308a\u30014\u751f\u7269\u306a\u308915\u901a\u308a\u30015\u751f\u7269\u306a\u3089105\u901a\u308a\u306b\u306a\u308a\u307e\u3059\u3002<\/p>\n<\/div>\n\n\n\n

\u6700\u5927\u7bc0\u7d04\u6cd5\u306e\u8003\u3048\u65b9\u306f\u30b7\u30f3\u30d7\u30eb\u3067\u3001\u3042\u308b\u6a39\u5f62\u306b\u3064\u3044\u3066\u3001\u6700\u4f4e\u3001\u4f55\u56de\u306e\u7f6e\u63db\u304c\u3042\u308c\u3070\u3053\u306e\u7cfb\u7d71\u6a39\u304c\u767a\u751f\u3059\u308b\u304b\uff1f<\/span><\/strong>\u3092\u8a08\u7b97\u3057\u307e\u3059\u3002
\u5168\u3066\u306e\u6a39\u5f62\u306b\u3064\u3044\u3066\u305d\u306e\u8a08\u7b97\u3092\u884c\u3044\u3001\u6700\u3082\u300c\u7f6e\u63db\u56de\u6570\u300d\u304c\u5c11\u306a\u304f\u3066\u6e08\u3093\u3060\u7cfb\u7d71\u6a39\u304c\u3001\u6700\u7bc0\u7d04\u6cd5\u306b\u304a\u3051\u308b\u300c\u6b63\u89e3\u300d<\/span><\/strong>\u3068\u306a\u308a\u307e\u3059\u3002<\/p>\n\n\n\n

\u3053\u306e\u3088\u3046\u306b\u3001\u7f6e\u63db\u306e\u56de\u6570\u3092\u898b\u308b\u3060\u3051\u306a\u306e\u3067\u3001\u6700\u7bc0\u7d04\u6cd5\u3067\u306f\u5206\u5c90\u306e\u9806\u756a\u306f\u5206\u304b\u308a\u307e\u3059\u304c\u3001\u7cfb\u7d71\u6a39\u306e\u679d\u306e\u9577\u3055\u306f\u5206\u304b\u3089\u306a\u3044<\/span><\/strong>\u4e8b\u306b\u3054\u6ce8\u610f\u304f\u3060\u3055\u3044\u3002<\/p>\n\n\n\n

\u6700\u5927\u7bc0\u7d04\u6cd5\u3092\u7528\u3044\u3066\u7cfb\u7d71\u89e3\u6790\u3067\u304d\u308b\u30c4\u30fc\u30eb\u306b\u306f\u3001\u300cPAUP*\u300d\u300cPhylip\u300d<\/strong>\u306a\u3069\u304c\u3042\u308a\u307e\u3059\u3002<\/p>\n\n\n\n

\u6700\u5c24\u6cd5<\/h3>\n\n\n\n

\u5b9f\u969b\u306e\u9032\u5316\u306f\u3001\u4e00\u5b9a\u306e\u30da\u30fc\u30b9\u3067\u9032\u3080\u308f\u3051\u3067\u306f\u306a\u304f\u3001\u751f\u7269\u7a2e\u306b\u3088\u3063\u3066\u307e\u3061\u307e\u3061\u3067\u3059\u3002
\u6700\u5c24\u6cd5\u306f\u78ba\u7387\u8ad6\u306e\u8003\u3048\u65b9\u3092\u53d6\u308a\u5165\u308c\u308b\u3053\u3068\u306b\u3088\u3063\u3066\u3001\u751f\u7269\u306b\u3088\u308a\u9032\u5316\u306e\u30b9\u30d4\u30fc\u30c9\u304c\u9055\u3046\u554f\u984c\u3092\u89e3\u6d88\u3057\u305f\u7cfb\u7d71\u6a39\u4f5c\u6210\u65b9\u6cd5<\/span><\/strong>\u3067\u3059\u3002<\/p>\n\n\n\n

\u3088\u3063\u3066\u3001\u5b8c\u6210\u3059\u308b\u7cfb\u7d71\u6a39\u306f\u679d\u306e\u9577\u3055\u307e\u3067\u542b\u3081\u3066\u8a08\u7b97\u3055\u308c\u307e\u3059\u3002
\u8a08\u7b97\u306f\u3084\u3084\u8907\u96d1\u3068\u306a\u308b\u305f\u3081\u3001\u6700\u7bc0\u7d04\u6cd5\u3088\u308a\u66f4\u306b\u6642\u9593\u304c\u639b\u304b\u308a\u307e\u3059\u3002\u3088\u3063\u3066\u3001\u6700\u7bc0\u7d04\u6cd5\u306e\u7ae0\u3067\u8ff0\u3079\u305f\u679d\u5208\u308a\u306e\u624b\u6cd5\u3068\u4f75\u7528\u3055\u308c\u308b\u4e8b\u304c\u307b\u3068\u3093\u3069\u3067\u3059\u3002<\/p>\n\n\n\n

\u6700\u5c24\u6cd5\u3092\u7528\u3044\u3066\u7cfb\u7d71\u89e3\u6790\u3067\u304d\u308b\u30c4\u30fc\u30eb\u306b\u306f\u300cPAUP*\u300d\u300cRAxML\u300d<\/strong>\u306a\u3069\u304c\u3042\u308a\u307e\u3059\u3002<\/p>\n\n\n\n

\u30d9\u30a4\u30ba\u6cd5<\/h3>\n\n\n\n

\u30d9\u30a4\u30ba\u6cd5\u3082\u6700\u5c24\u6cd5\u3068\u540c\u69d8\u306b\u3001\u78ba\u7387\u8ad6\u3092\u7528\u3044\u3066\u7cfb\u7d71\u6a39\u3092\u4f5c\u6210\u3059\u308b\u624b\u6cd5\u3067\u3059\u304c\u3001\u300c\u30d9\u30a4\u30ba\u78ba\u7387\u300d\u3068\u3044\u3046\u78ba\u7387\u3092\u7528\u3044\u3066\u7cfb\u7d71\u6a39\u4f5c\u6210\u3092\u884c\u3044\u307e\u3059\u3002<\/span><\/strong><\/p>\n\n\n\n

\u6700\u5c24\u6cd5\u3068\u30d9\u30a4\u30ba\u6cd5\u306e\u3069\u3061\u3089\u304c\u512a\u308c\u308b\u304b\u306b\u3064\u3044\u3066\u306f\u6d41\u6d3e\u304c\u5b58\u5728\u3057\u3066\u304a\u308a\u3001\u4e00\u6982\u306b\u512a\u52a3\u306f\u8a00\u3048\u307e\u305b\u3093\u3002
\u30d9\u30a4\u30ba\u3092\u7528\u3044\u3066\u7cfb\u7d71\u89e3\u6790\u3067\u304d\u308b\u30c4\u30fc\u30eb\u306b\u306f\u300cMrBayes\u300d\u300cPAML\u300d<\/strong>\u306a\u3069\u304c\u3042\u308a\u307e\u3059\u3002<\/p>\n\n\n\n

\u9032\u5316\u306e\u63a8\u6e2c<\/h2>\n\n\n\n

\u3055\u3066\u3001\u7cfb\u7d71\u6a39\u304c\u66f8\u3051\u305f\u3089\u3044\u3088\u3044\u3088\u751f\u7269\u9032\u5316\u306e\u6b74\u53f2\u304c\u6d6e\u304d\u5f6b\u308a\u306b\u306a\u3063\u3066\u304d\u307e\u3059\u3002
\u4f8b\u3048\u3070\u3001\u4eee\u306b\u4ee5\u4e0b\u306e\u3088\u3046\u306a\u7cfb\u7d71\u6a39\u304c\u4f5c\u6210\u3055\u308c\u305f\u3068\u3057\u307e\u3057\u3087\u3046\u3002<\/p>\n\n\n\n

\"\"<\/figure>\n\n\n\n\n\n\n\n

\u679d\u306e\u9577\u3055\u304c\u3046\u307e\u304f\u300c\u5206\u5c90\u3057\u3066\u304b\u3089\u7d4c\u904e\u3057\u305f\u6642\u9593\u300d\u3092\u8868\u73fe\u3057\u3066\u3044\u308b\u3068\u3059\u308c\u3070\u3001\u3053\u306e\u679d\u306e\u9577\u3055\u306e\u6bd4\u7387\u304c\u3001\u305d\u306e\u307e\u307e\u5e74\u4ee3\u306e\u9577\u3055\u3068\u6bd4\u4f8b\u3057\u3066\u3044\u308b\u3068\u4eee\u5b9a\u3067\u304d\u307e\u3059\u3002<\/span><\/strong>
\uff08\u3064\u307e\u308a\u3001\u6700\u5927\u7bc0\u7d04\u6cd5\u3067\u306f\u5206\u5c90\u306e\u9806\u756a\u306f\u5206\u304b\u308a\u307e\u3059\u304c\u679d\u306e\u9577\u3055\u306f\u5206\u304b\u308a\u307e\u305b\u3093\u306e\u3067\u3001\u5206\u5c90\u5e74\u4ee3\u306e\u63a8\u6e2c\u306b\u306f\u4f7f\u3048\u306a\u3044\u4e8b\u306b\u306a\u308a\u307e\u3059\u3002\uff09<\/p>\n\n\n\n

\u300c\u30d2\u30c8\u3068\u30a4\u30cc\u300d\u304c\u3044\u3064\u5206\u5c90\u3057\u305f\u306e\u304b\u3092\u6b63\u78ba\u306b\u8003\u3048\u308b\u306e\u306f\u96e3\u3057\u305d\u3046\u3067\u3059\u3002
\u3057\u304b\u3057\u300c\u30d2\u30c8\u3068\u30c1\u30f3\u30d1\u30f3\u30b8\u30fc\u300d\u306a\u3089\u3070\u3001\u5316\u77f3\u304c\u898b\u3064\u304b\u3063\u305f\u5c64\u306e\u6df1\u3055\u306a\u3069\u306e\u60c5\u5831\u304b\u3089\u3001\u3042\u308b\u7a0b\u5ea6\u300c\u4e8b\u5b9f\u30d9\u30fc\u30b9\u300d\u3067\u5e74\u4ee3\u304c\u63a8\u6e2c\u3067\u304d\u307e\u3059\u3002<\/p>\n\n\n\n

\u4f8b\u3048\u3070\u3001\u30d2\u30c8\u3068\u30c1\u30f3\u30d1\u30f3\u30b8\u30fc\u304c\u5206\u5c90\u3057\u305f\u5e74\u4ee3\u3092500\u4e07\u5e74\u524d\u3068\u3057\u307e\u3057\u3087\u3046\u3002
\u7cfb\u7d71\u6a39\u306b\u304a\u3051\u308b\u300c\u30d2\u30c8\u3068\u30a4\u30cc\u300d\u306e\u679d\u306e\u9577\u3055\u304c\u300c\u30d2\u30c8\u3068\u30c1\u30f3\u30d1\u30f3\u30b8\u30fc\u300d\u306e12\u500d\u3060\u3063\u305f\u3068\u3057\u305f\u3089\u3001\u300c\u30d2\u30c8\u3068\u30a4\u30cc\u300d\u304c\u5206\u5c90\u3057\u305f\u306e\u306f6,000\u4e07\u5e74\u524d\u3053\u308d\u3067\u306f\u306a\u3044\u304b\u3068\u63a8\u5b9a\u3059\u308b\u3053\u3068\u304c\u3067\u304d\u307e\u3059\u3002<\/p>\n\n\n\n

\u305d\u3046\u3044\u3046\u610f\u5473\u3067\u3001\u30af\u30e9\u30b9\u30bf\u30ea\u30f3\u30b0\u306e\u300c\u679d\u306e\u9577\u3055\u300d\u3068\u3044\u3046\u3082\u306e\u304c\u7cfb\u7d71\u89e3\u6790\u3067\u306f\u3068\u308a\u308f\u3051\u91cd\u8981<\/span><\/strong>\u306b\u306a\u3063\u3066\u304f\u308b\u308f\u3051\u3067\u3059\u3002
\uff08\u7814\u7a76\u30c6\u30fc\u30de\u306b\u3088\u3063\u3066\u306f\u5206\u5c90\u306e\u9806\u756a\u3055\u3048\u5206\u304b\u308c\u3070\u826f\u3044\u3001\u3068\u3044\u3046\u4e8b\u3082\u3042\u308a\u307e\u3059\u3002\uff09<\/p>\n\n\n\n

\u7cfb\u7d71\u89e3\u6790\u306e\u5fdc\u7528<\/h2>\n\n\n\n

\u3082\u3068\u3082\u3068\u306f\u751f\u7269\u306e\u5206\u5c90\u5e74\u4ee3\u3092\u63a8\u6e2c\u3059\u308b\u305f\u3081\u306b\u751f\u307e\u308c\u305f\u624b\u6cd5\u3067\u3059\u304c\u3001\u5225\u306e\u5206\u91ce\u306b\u5fdc\u7528\u3059\u308b\u4e8b\u4f8b\u3082\u898b\u3089\u308c\u3066\u3044\u307e\u3059\u3002<\/p>\n\n\n\n

\u4f8b\u3048\u3070\u3001\u5358\u8a9e\u306e\u4e26\u3073\u3092\u898b\u3066\u8a00\u8449\u306e\u9032\u5316\u3092\u8abf\u3079\u308b\u8a00\u8a9e\u306e\u7814\u7a76\u3002
\u3044\u3064\u306e\u6642\u4ee3\u306b\u3001\u611f\u8b1d\u306e\u8a00\u8449\u304c\u300c\u3042\u308a\u304c\u3068\u3046\u300d\u3068\u300c\u304a\u304a\u304d\u306b\u300d\u306b\u5206\u304b\u308c\u305f\u306e\u304b\uff1f\u306a\u3069\u3092\u3001\u6587\u5316\u7684\u306a\u5074\u9762\u3060\u3051\u3067\u306a\u304f\u3001\u7406\u8ad6\u7684\u306a\u5074\u9762\u304b\u3089\u3082\u8abf\u67fb\u3059\u308b<\/span><\/strong>\u3053\u3068\u304c\u3067\u304d\u307e\u3059\u3002<\/p>\n\n\n\n

\u304a\u308f\u308a\u306b<\/h2>\n\n\n\n

\u4ee5\u4e0a\u304c\u3001\u7cfb\u7d71\u89e3\u6790\u306b\u3064\u3044\u3066\u306e\u6982\u7565\u3067\u3057\u305f\u3002<\/p>\n\n\n\n

\u7cfb\u7d71\u89e3\u6790\u306b\u3064\u3044\u3066\u306f\u3001\u4ee5\u4e0b\u306e\u66f8\u7c4d\u306a\u3069\u306b\u3082\u4e01\u5be7\u306b\u89e3\u8aac\u3055\u308c\u3066\u3044\u307e\u3059\u3002
\u672c\u8a18\u4e8b\u306b\u8a18\u3057\u305f\u5185\u5bb9\u304c\u6570\u5b66\u7684\u306b\u4e01\u5be7\u306b\u89e3\u8aac\u3055\u308c\u3066\u304a\u308a\u3001\u73fe\u5728\u8ca9\u58f2\u3057\u3066\u3044\u308b\u65e5\u672c\u8a9e\u306e\u66f8\u7c4d\u306e\u4e2d\u3067\u306f\u3001\u6700\u3082\u5145\u5b9f\u3057\u3066\u3044\u308b\u306e\u3067\u306f\u306a\u3044\u304b\u3068\u8003\u3048\u3066\u3044\u307e\u3059\u3002<\/p>\n\n\n

\n\t
\n\t\t
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