分子生物学– tag –

BioPythonパッケージを使うと、Pythonで生物学関連のデータ分析を簡単に行うことができます。 この記事ではその入門編として、BioPythonを用いたDNA配列データの基本操作について整理しました。 BioPythonとは データ分析を目的としたプログラミングにはPy...

系統解析とは、生物の持つDNAなどの情報を基にして、生物の進化の過程を推測する技術のことを言います。複数の生物の進化の過程をトーナメント表のように表した「系統樹」と呼ばれる図を作成する事が多くの場合の目的になります。 系統樹を生物の教科書な...

前回は「進化距離」の意味から、最も単純な進化距離の計算手法である「P-distance(P距離)」についてご説明させて頂きました。 https://analysis-navi.com/?p=841 今回はもう少し複雑な進化距離の指標であるポアソン距離（Poisson Correction distance／Poi...

進化距離とは 「進化距離(evolutionary distance)」をご存知でしょうか。 「距離」という言葉は、広く使われている用法としては「家から病院までの距離」のように、その道の長さなどを測るために使われます。が、広義では、「ある2つのモノはどのくらい違...