2020年9月6日 / 最終更新日 : 2024年6月16日 Takuma Nishimaki 学習用記事 BioPythonによるバイオデータ分析入門 BioPythonパッケージを使うと、Pythonで生物データ分析を簡単に取り扱うことができます。 この記事ではその入門編として、BioPythonを用いたDNA配列データの基本操作について整理しました。 BioPyth […]
2019年11月23日 / 最終更新日 : 2024年9月17日 Takuma Nishimaki 学習用記事 「系統解析」の意味と様々な手法 系統解析とは、生物の持つDNAなどの情報を基にして、生物の進化の過程を推測する技術のことを言います。 複数の生物の進化の過程をトーナメント表のように表した「系統樹」と呼ばれる図を作成する事が多くの場合ゴールになります。 […]
2019年4月1日 / 最終更新日 : 2024年6月16日 Takuma Nishimaki 学習用記事 進化距離・その２〜Poisson distance編〜 「進化距離」の続編です。 前回は「進化距離」の意味から、最も単純な進化距離の計算手法である「P-distance(P距離)」についてご説明させて頂きました。 進化距離(evolutionary distance)の意味と […]
2019年3月2日 / 最終更新日 : 2024年6月16日 Takuma Nishimaki 学習用記事 進化距離(evolutionary distance)の意味と計算方法 進化距離とは 「進化距離(evolutionary distance)」という言葉をご存知でしょうか。 「距離」という言葉は、広く使われている用法としては「家から病院までの距離」のように、その道の長さなどを測るために使わ […]
